Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
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