Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms