Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCSER1Q9C0I3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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