Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms