Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM43Q9BTV4 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms