Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMARCE1Q969G3 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms