Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms