Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHDC9Q8NEP7 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms