Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKL3Q8IVW4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL3Q8IVW4 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms