Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms