Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMBR1LQ6UX01 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms