Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 POM121L6P-201ENST00000441186 1826 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 POU2F2-201ENST00000342301 3730 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms