Protein–RNA interactions for Protein: Q66GS9

CEP135, Centrosomal protein of 135 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP135Q66GS9 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP135Q66GS9 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms