Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC93Q567U6 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms