Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ALFQ53S48 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms