Protein–RNA interactions for Protein: Q53S33

BOLA3, BolA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA3Q53S33 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms