Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms