Protein–RNA interactions for Protein: Q3L8U1

CHD9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, humanhuman

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Length 2,897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9Q3L8U1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CHD9Q3L8U1 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CHD9Q3L8U1 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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CHD9Q3L8U1 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CHD9Q3L8U1 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CHD9Q3L8U1 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CHD9Q3L8U1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CHD9Q3L8U1 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CHD9Q3L8U1 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CHD9Q3L8U1 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CHD9Q3L8U1 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CHD9Q3L8U1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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CHD9Q3L8U1 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CHD9Q3L8U1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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