Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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RPE65Q16518 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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RPE65Q16518 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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RPE65Q16518 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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RPE65Q16518 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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RPE65Q16518 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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