Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 284.1 ms