Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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NCOA1Q15788 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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NCOA1Q15788 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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NCOA1Q15788 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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NCOA1Q15788 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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NCOA1Q15788 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCOA1Q15788 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCOA1Q15788 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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