Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIP10Q15642 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms