Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
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