Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNB1Q14721 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms