Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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