Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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