Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH18Q13634 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDH18Q13634 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms