Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TCIRG1Q13488 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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