Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 ARHGAP36-202ENST00000370921 2447 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 MCM5-202ENST00000382011 2402 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 PEG10-203ENST00000488574 2587 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 GOLGA1-202ENST00000373555 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 C4orf33-201ENST00000281146 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 AC004494.1-201ENST00000613210 2775 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 CPT1B-204ENST00000405237 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 ENDOU-201ENST00000229003 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 SYPL2-201ENST00000369872 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 ASTN1-203ENST00000367657 4187 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 NFASC-202ENST00000360049 10120 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 NFASC-225ENST00000539706 10135 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 FBLN2-201ENST00000295760 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 PANK2-206ENST00000497424 4815 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 ERCC1-202ENST00000300853 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 PAM-204ENST00000348126 3622 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 KCNH1-205ENST00000638498 3479 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 TSPEAR-204ENST00000614657 4027 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 PRIMA1-202ENST00000393140 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 INAVA-201ENST00000367342 4298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 C16orf82-202ENST00000505035 2459 ntAPPRIS P5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 CLINT1-206ENST00000523094 3987 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 AC017083.4-201ENST00000406334 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 CCDC36-204ENST00000452691 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 FP565324.1-201ENST00000636427 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 GNAT1-201ENST00000232461 2417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 LILRB1-208ENST00000427581 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 RAB43-204ENST00000393307 4203 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 AC008158.1-201ENST00000578759 3668 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms