Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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ITGB3BPQ13352 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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ITGB3BPQ13352 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
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ITGB3BPQ13352 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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ITGB3BPQ13352 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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ITGB3BPQ13352 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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ITGB3BPQ13352 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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ITGB3BPQ13352 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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