Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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