Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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