Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms