Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DDR1Q08345 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms