Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms