Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBE1Q04446 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GBE1Q04446 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GBE1Q04446 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GBE1Q04446 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GBE1Q04446 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GBE1Q04446 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GBE1Q04446 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms