Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMF1P82094 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMF1P82094 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMF1P82094 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMF1P82094 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMF1P82094 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMF1P82094 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMF1P82094 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMF1P82094 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMF1P82094 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMF1P82094 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMF1P82094 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMF1P82094 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMF1P82094 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMF1P82094 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMF1P82094 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMF1P82094 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMF1P82094 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMF1P82094 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMF1P82094 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMF1P82094 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMF1P82094 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMF1P82094 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMF1P82094 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMF1P82094 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMF1P82094 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMF1P82094 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMF1P82094 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMF1P82094 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMF1P82094 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMF1P82094 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMF1P82094 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMF1P82094 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMF1P82094 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMF1P82094 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMF1P82094 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMF1P82094 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMF1P82094 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMF1P82094 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMF1P82094 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMF1P82094 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMF1P82094 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMF1P82094 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMF1P82094 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMF1P82094 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMF1P82094 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMF1P82094 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMF1P82094 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMF1P82094 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMF1P82094 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMF1P82094 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMF1P82094 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMF1P82094 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMF1P82094 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms