Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LMO4P61968 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LMO4P61968 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LMO4P61968 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LMO4P61968 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms