Protein–RNA interactions for Protein: P59046

NLRP12, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP12P59046 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NLRP12P59046 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms