Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATMP50440 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATMP50440 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATMP50440 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATMP50440 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATMP50440 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATMP50440 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATMP50440 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATMP50440 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATMP50440 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATMP50440 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GATMP50440 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATMP50440 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATMP50440 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATMP50440 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATMP50440 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATMP50440 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GATMP50440 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATMP50440 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATMP50440 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATMP50440 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATMP50440 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATMP50440 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATMP50440 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATMP50440 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATMP50440 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATMP50440 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATMP50440 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATMP50440 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATMP50440 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATMP50440 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATMP50440 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATMP50440 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATMP50440 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATMP50440 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms