Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP8P40818 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP8P40818 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP8P40818 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP8P40818 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP8P40818 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP8P40818 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP8P40818 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
USP8P40818 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP8P40818 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP8P40818 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP8P40818 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP8P40818 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP8P40818 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP8P40818 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP8P40818 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP8P40818 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP8P40818 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP8P40818 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP8P40818 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP8P40818 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP8P40818 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP8P40818 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP8P40818 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP8P40818 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP8P40818 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP8P40818 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP8P40818 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP8P40818 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP8P40818 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP8P40818 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP8P40818 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP8P40818 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP8P40818 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP8P40818 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP8P40818 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP8P40818 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP8P40818 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
USP8P40818 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP8P40818 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP8P40818 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP8P40818 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP8P40818 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP8P40818 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP8P40818 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP8P40818 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms