Protein–RNA interactions for Protein: P40222

TXLNA, Alpha-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNAP40222 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXLNAP40222 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms