Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms