Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms