Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms