Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC13P31276 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXC13P31276 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.6 ms