Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD40LGP29965 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms