Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms