Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRHP20396 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRHP20396 MIR6749-201ENST00000617008 69 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRHP20396 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRHP20396 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRHP20396 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRHP20396 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRHP20396 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRHP20396 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRHP20396 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRHP20396 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRHP20396 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRHP20396 RCL1-206ENST00000442869 1644 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRHP20396 GABPB1-206ENST00000543881 1450 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRHP20396 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRHP20396 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRHP20396 MB-204ENST00000401702 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRHP20396 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRHP20396 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRHP20396 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRHP20396 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRHP20396 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRHP20396 AC022382.1-201ENST00000602768 336 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRHP20396 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRHP20396 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRHP20396 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRHP20396 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRHP20396 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRHP20396 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRHP20396 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRHP20396 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRHP20396 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRHP20396 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRHP20396 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRHP20396 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRHP20396 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRHP20396 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRHP20396 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRHP20396 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRHP20396 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRHP20396 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRHP20396 WRB-202ENST00000380708 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRHP20396 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRHP20396 SLC36A1-211ENST00000616007 1389 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRHP20396 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRHP20396 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRHP20396 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRHP20396 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRHP20396 TIMM23B-201ENST00000374098 1142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRHP20396 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRHP20396 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRHP20396 TMEM256P1-201ENST00000430550 340 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRHP20396 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRHP20396 AC009646.2-202ENST00000524425 826 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRHP20396 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRHP20396 AC116036.2-201ENST00000607592 462 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRHP20396 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRHP20396 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRHP20396 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRHP20396 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRHP20396 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRHP20396 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRHP20396 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRHP20396 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRHP20396 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 AC234771.1-201ENST00000416873 250 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 AC126177.4-201ENST00000547452 731 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 NKAPP1-203ENST00000554109 573 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 IMPDH1P5-201ENST00000439688 1540 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRHP20396 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRHP20396 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRHP20396 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRHP20396 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRHP20396 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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