Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDSP20132 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SDSP20132 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDSP20132 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDSP20132 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDSP20132 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDSP20132 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDSP20132 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDSP20132 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDSP20132 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDSP20132 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDSP20132 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDSP20132 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDSP20132 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDSP20132 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SDSP20132 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDSP20132 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDSP20132 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms